腸内細菌叢（マイクロバイオーム）は、消化器疾患のみならず、肝疾患や神経疾患など様々な病態と関連することが近年明らかとなってきた。とくに「腸肝脳軸（gut–liver–brain axis）」と呼ばれる概念は、腸内細菌叢の破綻（dysbiosis）が肝性脳症（hepatic encephalopathy: HE）の病態進行に深く関与している可能性を示唆しており、人医療においても重要な研究テーマとなっている。一方、獣医領域においては、HEにおける腸内細菌叢の動態やそれに基づく治療介入法についての知見は極めて乏しいのが現状である。
　そこで私は、先天性門脈体循環シャント（CPSS）に罹患した犬を対象として、糞便16S rRNA遺伝子解析による腸内細菌叢の変化や、アンモニア・内毒素の産生に関わる微生物群の特定を行っている。さらに、抗菌薬リファキシミンを用いた治療前後におけるマイクロバイオームの推移を longitudinal に評価し、HEの病態進行に関与する微生物学的メカニズムの解明と、腸内細菌叢を標的とした新たな治療戦略の確立を目指している。